ChipST2C Version 1.0
Run date:3/27/2005
(C) 2004-5	Peterson Lab	Baylor College of Medicine
http://www.chipst2c.org
k-sample Kruskal-Wallis test
Type I Error level (alpha): 1.0000
Number of genes tested: 14
Randomization test not performed
No adjustment made for multiple tests
Number of genes significant (p<1.0000):14
	EWS	BL	NB	RMS	EWS	BL	NB	RMS
N	N_1	N_2	N_3	N_4	AvgRank_1	AvgRank_2	AvgRank_3	AvgRank_4	p-value	q-value	FDR	Chi-square	d.f.	Mean_Perm_Chi-Square	Permutations	Gene	EWS-T1	EWS-T2	EWS-T3	EWS-T4	EWS-T6	EWS-T7	EWS-T9	EWS-T11	EWS-T12	EWS-T13	EWS-T14	EWS-T15	EWS-T19	EWS-C8	EWS-C3	EWS-C2	EWS-C4	EWS-C6	EWS-C9	EWS-C7	EWS-C1	EWS-C11	EWS-C10	BL-C5	BL-C6	BL-C7	BL-C8	BL-C1	BL-C2	BL-C3	BL-C4	NB-C1	NB-C2	NB-C3	NB-C6	NB-C12	NB-C7	NB-C4	NB-C5	NB-C10	NB-C11	NB-C9	NB-C8	RMS-C4	RMS-C3	RMS-C9	RMS-C2	RMS-C5	RMS-C6	RMS-C7	RMS-C8	RMS-C10	RMS-C11	RMS-T1	RMS-T4	RMS-T2	RMS-T6	RMS-T7	RMS-T8	RMS-T5	RMS-T3	RMS-T10	RMS-T11
63	23	8	12	20	51.47826087	9.875	18.25	26.7	5.53E-10	5.53E-10	0	46.05040437	3	0	1	Fc fragment of IgG; receptor; transporter; alpha_770394	4.0134	2.3451	4.1262	5.1079	3.9941	3.4064	2.6916	2.3477	3.6247	2.5821	3.1955	4.1509	4.6412	4.5169	0.4944	1.7248	2.347	4.0513	5.2958	5.2135	3.2644	3.6355	3.3071	0.1647	0.338	0.0669	0.1433	0.0967	0.3616	0.4264	0.1738	0.308	0.3533	0.4402	0.3059	0.2557	0.4325	0.318	0.3297	0.4416	0.4786	0.4782	0.1814	0.3391	0.5027	1.4465	0.7983	0.1634	0.3339	0.316	0.3505	0.5697	0.6855	0.282	0.9931	0.3472	0.8648	1.4401	0.5444	0.6624	0.6417	0.8647	0.2135
63	23	8	12	20	32.13043478	59.5	19.41666667	28.4	2.03E-05	2.03E-05	0	24.43355547	3	0	1	Wiskott-Aldrich syndrome (ecezema-thrombocytopenia)_236282	0.1844	0.2833	0.2713	0.3253	0.2585	0.2248	0.4035	0.3533	0.1493	0.2142	0.1557	0.1942	0.3654	0.3325	0.1205	0.1557	0.3315	0.5093	0.4954	0.1288	0.2411	0.1331	0.189	0.7904	0.9508	1.3086	1.3896	0.7992	0.8609	0.9478	1.2604	0.1603	0.2011	0.2589	0.0713	0.0974	0.1823	0.3159	0.1511	0.2412	0.0364	0.1992	0.0756	0.5158	0.2974	0.2744	0.1735	0.1511	0.136	0.2693	0.162	0.0756	0.1011	0.2649	0.2956	0.5903	0.1521	0.1647	0.2031	0.3699	0.2915	0.1499	0.1745
63	23	8	12	20	27.34782609	9.625	47.33333333	37.1	3.42E-05	3.42E-05	0	23.34655042	3	0	1	matrix metalloproteinase 2 (gelatinase A; 72kD gelatinase; 72kD type IV collagenase)_1474174	0.552	0.487	1.2167	1.2098	1.855	0.5032	0.7151	0.8308	0.7622	5.5433	0.6322	1.6036	1.2185	0.214	0.4115	0.2492	0.5228	0.4836	0.4694	1.0283	0.0408	0.1909	0.1887	0.2868	0.2057	0.1955	0.1396	0.3051	0.3364	0.2169	0.2445	1.3332	3.4272	2.4484	1.3045	0.527	3.936	0.8467	1.3392	1.1737	3.277	1.9651	1.1104	0.2693	1.068	1.4694	1.0772	0.3608	0.1385	1.6236	0.82	0.6704	1.4989	0.5894	1.6953	0.4449	1.9968	1.7326	4.5867	1.2229	0.6382	2.929	0.6937
63	23	8	12	20	43.91304348	11.375	26.58333333	29.8	9.67E-05	9.67E-05	0	21.17911383	3	0	1	annexin A1_208718	3.4296	2.2009	1.6881	4.1756	3.0405	0.329	0.9198	0.848	1.3026	3.5814	1.1629	1.7367	0.6336	0.4531	4.9368	6.0212	1.041	0.9217	0.8264	1.0096	0.6779	0.5496	0.1647	0.1655	0.0772	0.1087	0.1015	0.1105	0.1504	0.0932	0.1924	0.0948	3.8927	1.0259	0.6702	0.1271	4.2105	0.0715	0.0705	0.1663	0.9384	0.566	0.15	0.1023	0.2513	0.1688	1.361	0.0857	0.0746	0.2002	3.5375	0.3039	0.327	1.1758	0.7503	1.0354	0.9447	0.7794	0.5067	0.7116	0.6825	0.1417	1.2442
63	23	8	12	20	35.04347826	13.5	24.25	40.55	0.001595927	0.001595927	0	15.27929607	3	0	1	collagen; type V; alpha 2_796613	0.4118	0.5939	0.7967	4.593	0.7386	0.3141	0.6591	0.3454	0.1999	0.7188	0.8249	0.3539	0.45	0.1809	1.2643	0.8346	0.2515	0.1225	0.1193	0.1452	0.2553	0.1337	0.1531	0.1092	0.2105	0.066	0.074	0.1321	0.142	0.1004	0.1614	0.1165	0.5219	0.2325	0.3433	0.0967	0.6219	0.1137	0.0868	0.0966	0.4387	0.6519	0.1639	0.0069	0.2289	0.0071	1.7247	0.102	0.093	1.3791	0.1795	0.3365	2.9883	0.8975	1.425	1.0058	1.8926	1.15	2.1732	1.7993	1.0208	2.5074	0.3961
63	23	8	12	20	34.13043478	39.75	16.33333333	35.85	0.009837672	0.009837672	0	11.38891261	3	0	1	mevalonate (diphospho) decarboxylase_280934	0.2353	0.3185	0.5112	0.1516	0.4868	0.417	0.6619	0.422	0.3997	0.4241	0.6424	0.5026	0.5256	0.7268	0.3043	0.4095	0.4624	0.2612	0.2456	0.2847	0.2663	0.3565	0.3004	0.2035	0.5037	0.3464	0.3171	0.3776	1.0846	0.5816	0.9566	0.8696	0.2379	0.2153	0.1166	0.0494	0.116	0.383	0.3375	0.2319	0.0676	0.1123	0.1079	0.5888	0.8222	0.3945	0.1541	0.4759	0.7876	0.1601	0.6745	0.0707	0.2894	0.4174	0.5302	1.1877	0.0471	0.2213	0.4327	0.5159	0.5845	0.2819	0.4334
63	23	8	12	20	34.69565217	20.875	44.08333333	26.1	0.013335934	0.013335934	0	10.73077014	3	0	1	membrane fatty acid (lipid) desaturase_324891	0.3899	0.7067	0.4545	0.3432	0.599	0.3503	0.7519	0.3867	0.4141	0.5013	0.2738	0.4685	0.2612	0.7841	0.6533	0.937	0.7962	0.4489	0.421	0.6206	0.5274	0.4523	0.3139	0.285	0.5936	0.4581	0.2571	0.2757	0.2854	0.2679	0.5652	0.6347	0.6762	0.5653	0.5455	0.7752	0.9567	0.4538	0.5078	0.4238	0.4224	0.6116	0.6744	0.2875	0.4057	0.1967	0.4777	0.2332	0.6532	0.5689	0.7384	0.3141	0.5382	0.6427	0.2955	0.7455	0.0552	0.4447	0.3173	0.4528	0.4628	0.2551	0.2019
63	23	8	12	20	39.86956522	34.375	20.41666667	28.95	0.021234697	0.021234697	0	9.71919535	3	0	1	transmembrane glycoprotein_510542	0.8177	0.6514	0.6281	0.3322	0.8515	0.7833	1.1911	0.8924	0.8877	0.684	1.3937	1.3349	0.625	0.8564	0.6494	0.749	1.1877	1.3503	1.1213	0.9942	0.4797	0.5829	1.0827	0.7488	0.582	0.6222	1.0319	0.4832	0.5878	0.8454	1.6154	1.5684	0.5177	0.4869	0.3254	0.3445	0.3134	0.594	0.9969	0.4834	0.44	0.3302	0.5658	0.245	0.8683	1.0364	0.4889	0.7217	0.3355	0.5707	1.1005	0.3809	0.7296	1.4496	0.6012	1.4885	0.1974	0.6949	0.9476	0.4965	1.1199	0.1028	0.1512
63	23	8	12	20	34.69565217	21.625	22.58333333	38.7	0.030884657	0.030884657	0	8.899222524	3	0	1	interferon-induced protein 56_823696	0.2512	0.2565	0.2402	0.3103	0.2812	0.2526	0.3359	1.3713	2.0956	0.4979	0.2188	0.2418	0.2877	0.2113	0.0974	0.041	0.1021	0.081	0.0748	0.1876	0.0417	0.0383	0.0724	0.0736	0.0838	0.1786	0.1697	0.1022	0.113	0.1168	0.1041	0.084	0.2402	0.2003	0.1535	0.0892	0.203	0.0694	0.075	0.1574	0.0718	0.2147	0.0733	0.1523	0.2538	0.1037	0.5134	0.1174	0.1158	0.0601	0.3747	0.0794	0.2402	0.1401	0.905	0.1712	0.4845	0.8391	0.3466	0.3242	0.2328	0.1494	0.2522
63	23	8	12	20	36	16.125	37.66666667	30.35	0.038671908	0.038671908	0	8.404489087	3	0	1	ESTs_773203	0.3749	0.3159	0.2967	0.4287	0.4027	0.2838	0.6741	0.7142	0.468	0.1529	0.5172	0.4185	0.4534	0.7835	0.2558	0.4341	0.3473	0.4768	0.4193	0.352	0.1936	0.9088	0.6894	0.1148	0.2703	0.3778	0.5088	0.264	0.1468	0.2748	0.2585	0.311	0.5639	0.441	0.4423	0.3145	0.324	0.7074	0.7563	0.3393	0.3542	0.4822	0.3801	0.2913	0.7241	0.8507	0.2832	0.4968	0.6244	0.3884	0.2548	0.3941	0.1174	0.4413	0.418	0.3659	0.2765	0.131	0.3045	0.5828	0.2701	0.5156	0.2881
63	23	8	12	20	26.56521739	23.125	41.66666667	36	0.042678528	0.042678528	0	8.186923094	3	0	1	protein phosphatase 1; catalytic subunit; beta isoform_132911	0.4159	0.7679	0.4913	2.295	2.2223	3.4833	0.9774	0.9847	2.1517	1.1572	1.9762	1.6878	1.66	0.5287	0.6715	1.413	0.8542	0.6148	0.5776	1.3734	0.9652	0.5417	0.6676	1.9981	1.5157	1.7293	1.2756	0.3962	0.2748	0.3762	0.8874	0.8578	1.8339	1.2809	1.6576	1.026	2.0875	1.7097	3.2903	1.4258	2.6664	1.9833	2.2516	2.034	2.5521	1.2505	1.8101	1.4425	1.9485	2.9702	1.4022	3.0497	1.6788	1.3374	0.32	0.5825	2.9365	2.4137	1.4638	1.4631	0.815	1.0676	0.3508
63	23	8	12	20	38.47826087	18.375	27.16666667	32.9	0.0429026	0.0429026	0	8.175354771	3	0	1	ESTs_191743	0.4548	0.2902	0.3783	0.1045	0.5564	0.4407	0.4687	0.5514	0.5911	0.5016	0.6823	0.7497	0.3271	1.0191	0.8775	0.5773	0.1387	0.9623	0.9051	0.6119	0.1057	0.7884	1.2013	0.2855	0.3028	0.227	0.3067	0.1832	0.406	0.2911	0.2616	0.446	0.5629	0.5148	0.1583	0.2217	0.1447	0.3356	0.7803	0.7335	0.584	0.2169	0.1193	0.0156	0.7886	1.101	0.2516	0.7357	0.3857	0.4826	0.879	0.3911	0.4642	0.3737	0.3445	0.3898	0.0091	0.2589	0.3653	1.0001	0.1548	0.7911	0.5992
63	23	8	12	20	31.13043478	44.375	34.33333333	26.65	0.135859274	0.135859274	0	5.596129874	3	0	1	lectin; galactoside-binding; soluble; 3 (galectin 3)_855910	1.2677	2.9708	0.7412	0.2568	0.545	1.3256	1.4483	0.7147	1.1692	0.238	0.3724	0.3294	1.9151	0.7461	1.444	0.7754	1.3206	2.3762	2.2333	0.9494	2.1366	2.1122	1.1802	1.5397	1.4921	1.5567	0.4453	3.6545	3.0867	1.4674	1.9951	2.2559	0.8355	0.5086	2.5402	0.8559	1.3504	1.9934	0.444	0.7717	1.9022	1.4525	0.9835	4.151	2.0665	0.3521	2.7623	0.7578	1.1261	1.5137	0.7057	1.5689	0.2275	0.6666	0.6201	0.6409	2.0168	0.2674	0.4107	0.8137	1.0337	0.6736	0.5355
63	23	8	12	20	37.60869565	32.875	26.58333333	28.45	0.277054383	0.277054383	0	3.969583549	3	0	1	phosphorylase; glycogen; muscle (McArdle syndrome; glycogen storage disease type V)_759173	1.8315	2.318	1.812	0.7246	1.1547	0.8832	1.3914	1.0342	0.8571	1.0338	0.7344	0.4667	3.215	0.6186	3.9757	3.6989	1.9817	1.9295	1.9405	2.2274	2.5508	1.0582	0.7106	1.5168	0.7593	0.8509	0.8763	1.4374	1.3073	1.7446	1.2037	1.2647	0.7941